پژوهشكده رويان به عنوان يكي از مراكز پيشرو در ارائه خدمات درمان ناباروري در سال 1369 با هدف ارائه خدمات درمان ناباروري و انجام پژوهش هاي بنيادي و كاربردي در زمينه علوم و فناوري هاي كمك كننده باروري (ART) با همت زنده ياد دكتر سعيد كاظمي آشتياني و گروهي از همكاران پرتلاشش تأسيس شد.
اكنون با گذشت نزديك به دو دهه،‌ پژوهشكده رويان توانسته است به يكي از معتبرترين مراكز ارائه خدمات تخصصي و فوق تخصصي در خاورميانه تبديل شود. به طوري كه علاوه بر هزاران زوج ايراني نابارور، به طور ميانگين سالانه بيش از سيصد زوج نيز از كشورهاي خاورميانه، اروپا، امریکا، افریقا و استراليا به اين مركز براي درمان مراجعه مي كنند.
با يقين مي توان گفت روشي براي درمان ناباروري در دنيا شناخته و به كار گرفته نشده است كه در پژوهشكده رويان آن روش به زوج هاي نابارور ارائه نشود.
آزمايش ها و اقدامات درمان نوین تخصصی ناباروری نظیر IVF ,IVM ,IUI، ميكرواينجكشن، PGD، ليزر هچينگ،‌ سيتوژنتيك و اقدامات جراحی نظیر واريكوسلكتومي، لاپاراسكوپي،  و ... با پيشرفته ترين تجهيزات و توسط تيم هاي تخصصي مجرب و ورزيده در پژوهشكده رويان قابل انجام است.


پژوهشكده رويان در سال 1380 با تلاش هاي دكتر سعيد كاظمي آشتياني و همكارانش به عرصه تحقيقات سلول هاي بنيادي وارد شد كه اين تحقيقات در سال 1382 به نتيجه رسيد و پژوهشكده رويان با توليد رده سول هاي بنيادي جنيني نام ايران را در بين 10 كشور برتر دنيا كه به اين فناوري دست يافته اند قرار داد.
اولين كودك حاصل از روش IVF در ايران در اين پژوهشكده در سال 1371، دومين كودك حاصل از روش ميكرواينجكشن در ايران در سال 1373 در پژوهشكده رويان و اولين كودك حاصل از روش PGD در ايران در سال 1383 در پژوهشكده رويان متولد شده است.
توليد اولين رده سلول هاي بنيادي جنيني در ايران در سال 1382، تولد اولين گوسفند شبيه سازي شده در ايران در سال 1385، بهره گيري از سلول هاي بنيادي در درمان بيماران با ضايعات قلبي و بيماران با سوختگی های قرنيه چشم در سال 1383 و براي نخستين بار در كشور، و بسياري توفيقات ديگر بخشي از موفقيت هاي پژوهشكده رويان در طي دوران فعاليتش بوده است.